前天半夜接收了boss的文献，加急阅读后，今天与之探讨。内容主要为后续开展的研究方向，整体和之前所定的不变，大方向还是探究弓形虫和宿主的代谢互作机制，阐明寄生虫依赖的核心代谢通路，探索寄生虫为什么要”寄生“。在此基础上进行了细化，分为两条路径，此外还提出了一些涉及表观遗传的子课题，详细如下
# 对于不同阶段的弓形虫，其转录组等组学数据非常丰富，基于此条件及约束，构建代谢网络模型，分析不同阶段弓形虫的代谢差异。
# 故事点：寄生虫为何要寄生？猫为什么是唯一的终末宿主？
# 困难点：代谢网络模型的构建？实验和所述故事的结合？
重要性：★★★★★
# 筛选弓形虫代谢相关基因对其生长、发育的重要性
# 纯湿实验向，筛选出重要的代谢相关基因，最终结合代谢网络模型做比较分析，干湿结合，提高文章水平。
# 困难点：实验技能
重要性：★★★★
# 问题来源：来自单克隆，遗传物质完全相同的弓形虫速殖子，在培养过程中，总有一部分缓殖子的存在，反之亦然。这种现象是因为表观遗传学导致的。目前课题组研究手段是基于整体开展实验，很难考虑到不同细胞的异质性，无法解析上述问题。
# 目前有很多单细胞水平研究表观遗传学的方法，有些甚至能同时探究不同的组蛋白修饰和基因表达情况，将其应用到弓形虫或者宿主细胞（弓形虫感染前后），可以得到很多有趣的结果，比如弓形虫发育的异质性，不同宿主细胞的变化等。
# 困难点：背景知识了解+相关实验 （相对代谢建模要简单的多）
# 任务：整理相关方法异同，优缺点和应用场景。 后续可能组建团队开展此课题。
重要性：★★★
# 介绍了先进院的陈禹老师，boss对其不太了解，但肯定了他的成果，近期也会对他的文章进行阅读，学习他的思路。
# boss更偏向于找华农本土的课题组进行合作，交流更加方便，也利于我去学习等。陈禹课题组可能也会联系，都是后续的事情了。
# 近期需要重拾代谢网络建模的学习，依然是以自学为主，把这方面工作推进起来。这也是很多方向开展的前提！